Käimasolevad projektid

• Peipsi Koostöö Keskuse kommunikatsioonialaste oskuste arendamise projekti rahastavad regionaalministri valitsemisala ja Kodanikuühiskonna Sihtkapital

  
  

• Greenman on Eesti-Läti-Vene koostööprojekt arendamaks piirialade linnade Tartu, Rezekne ja Pihkva haljasalasid ja nende majandamist.
  

• Doonau jõe delta arengukoostööprojekt viiakse ellu koos Ukraina partneritega ning peamiseks eesmärgiks on delta integreeritud veemajandamise arendamine ning Ukraina Doonau Vesikonna Nõukogu alusdokumentide ning veebilehekülje väljatöötamine

• People with Nature on Eesti-Läti-Vene koostööprojekt, mille eesmärgiks on ühistegevuste kaudu tõsta inimeste teadlikkust säästvast arengust ja looduskaitsest Eesti-Läti-Vene projektipiirkonnas.

• Õppekäigud Lõuna-Eesti õpetajatele  Õppekäikudele läheme Peipsimaale, Põhja-Lätti, Kõrvemaale, Läänemaale ja Võrumaa parkidesse. Iga õppekäigu kohta valmib ülevaade, mida õpetajad saavad edaspidi õpilastega ekskursioonile minekuks kasutada.
  

•  EUBORDERREGIONS on EL teaduse 7.Raamprogrammi projekt, kus osaleb 14 EL ülikooli ja teadusinistituuti  ning mille eesmärgiks on uurida sotsiaal-majanduslikke ja regionaalpoliitika alaseid probleeme EL välisipiirialadel sh. Eesti-Vene piirialal.

• Loodusharidus Peipsi-kandi lasteaedades projekti tegevustega luuakse mitmekesisemaid võimalusi Jõgevamaa Peipsi-kandi neljas lasteaias (Tiheda, Mustvee, Saare ja Pala) loodusõppega tegelemiseks - toimuvad õppekäigud ja teemapäevad lastele, valmib õuesõppejuhend ning läbi viiakse õuesõppeteemaline koolitus, 2013.a. kevadel valmib loodushariduslik Jussi multifilm Peipsi järvest.
  

• Peipsi CTC annetusprogramm on projekt heade algatuste ja tegevuste toetuseks Peipsi CTC annetussüsteemi väljatöötamiseks, mida rahastavad regionaalministri valitsemisala ja Kodanikuühiskonna Sihtkapital
  

• Living Lakes ülemaailmsesse võrgustikku kuulub Peipsi järv alates 2003. a. 

  2010-2011 osaleb Peipsi Koostöö Keskus koos mitme Living Lakes võrgustiku Euroopa partneriga projektis SLOW TOUR, mis keskendub järvepiirkondade säästva arengu ja konkurentsivõime edendamisele.